标题: 杨朝勇教授课题组:单细胞谱系示踪领域研究新进展 [打印本页] 作者: mitao 时间: 2022-3-8 16:00 标题: 杨朝勇教授课题组:单细胞谱系示踪领域研究新进展 近日,我院杨朝勇教授课题组在单细胞谱系示踪领域取得新进展,相关成果以" LINEAGE:Label Free Identification of Endogenous Informative Single Cell Mitochondrial RNA Mutation for Lineage Analysis"为题,发表于Proceedings of the National Academy of Sciences(DOI: 10.1073/pnas.2119767119)。
谱系示踪技术是研究细胞发育、疾病发生以及癌细胞克隆进化的重要分析方法。随着单细胞转录组测序(scRNA-seq)技术和相关计算工具的发展,scRNA-seq数据已被应用于细胞谱系信息的挖掘。传统的谱系示踪技术和基于基因编辑的谱系分析都受限于复杂的实验操作,难以应用于临床样本;以全基因组上的RNA突变为内源性条形码的谱系分析方法又对测序覆盖度有高要求;相比之下,高频、可传代的线粒体基因组RNA突变是内源性条形码的较优选择,然而已有方法需要同批样本的群体染色质可及性测序(bulk ATAC-seq)或者全基因组测序数据进行谱系信息提取,同样限制了其应用。